1809年俄國物理學家Рейсе**發現電泳現象。他在濕粘土中插上帶玻璃管的正負兩個電極，加電壓后發現正極玻璃管中原有的水層變混濁，即帶負電荷的粘土顆粒向正極移動，這就是電泳現象。 1909年Michaelis**將膠體離子在電場中的移動稱為電泳。他用不同pH的溶液在U形管中測定了轉化酶和過氧化氫酶的電泳移動和等電點。
1937年瑞典Uppsala大學的Tiselius對電泳儀器作了改進，創造了Tiselius電泳儀，建立了研究蛋白質的移動界面電泳方法，并**證明了血清是由白蛋白及α、β、γ球蛋白組成的，由于Tiselius在電泳技術方面作出的開拓性貢獻而獲得了1948年的諾貝爾化學獎。
1948年Wieland和Fischer重新發展了以濾紙作為支持介質的電泳方法，對氨基酸的分離進行過研究。
從本世紀50年代起，特別是1950年Durrum用紙電泳進行了各種蛋白質的分離以后，開創了利用各種固體物質（如各種濾紙、醋酸纖維素薄膜、瓊脂凝膠、淀粉凝膠等）作為支持介質的區帶電泳方法。
1959年Raymond和Weintraub利用人工合成的凝膠作為支持介質，創建了聚丙烯酰胺凝膠電泳，極大地提高了電泳技術的分辨率，開創了近代電泳的新時代。30多年來，聚丙烯酰胺凝膠電泳仍是生物化學和分子生物學中對蛋白質、多肽、核酸等生物大分子使用*普遍，分辨率*高的分析鑒定技術，是檢驗生化物質的*高純度：即"電泳純"（一維電泳一條帶或二維電泳一個點）的標準分析鑒定方法，至今仍被人們稱為是對生物大分子進行分析鑒定的*后、*準確的手段，即"Last Check"。
由80年代發展起來的新的毛細管電泳技術，是化學和生化分析鑒定技術的重要新發展，己受到人們的充分重視。